Les VERT-E-S Fribourg sont présent-e-s sur l’ensemble du territoire cantonal avec 7 sections régionales (qui couvrent un ou plusieurs cercles électoraux) et une section Jeunes Vert·e·x·s. Selon les art. 17 et 19 des statuts, les sections sont des associations autonomes et sont représentées au comité cantonal des VERT-E-S Fribourg.

Dans certaines communes, des groupes régionaux (art. 18 des statuts) ont été constitués pour renforcer la présence verte dans ces localités (Estavayer-le-Lac, Kerzers, Marly, Villars-sur-Glâne).